Этот вид бакланов не только редкий, но и специфичный для Сибири. Численность птиц сокращается: многие бакланы гибнут в рыболовных сетях.
Отметим, малый баклан занесен в Красную книгу. Обитает в основном в Южной Европе, Средней Азии. Два года назад бакланы примерно в это же время прилетали в Новосибирск. Орнитологи объясняли визит птиц тем, что их занесло бурей.